मछली के आटे में उच्च प्रोटीन सामग्री होती है और इसकी पचने की दर 90% से अधिक है। इसमें संतुलित अमीनो एसिड भी होते हैं, जो लाइसिन, ट्रिप्टोफैन, मेथियोनीन और सिस्टीन से भरपूर होते हैं। कच्चे माल की गुणवत्ता के कारण मछली आटे में प्रोटीन की मात्रा में काफी भिन्नता होती है। संयुक्त राज्य अमेरिका में, मछली आटे को कच्चे प्रोटीन की मात्रा के अनुसार तीन स्तरों में विभाजित किया जाता है: 55%–60%, 60%–65%, और 65% से अधिक।.
मछली के आटे में लाइसिन 4% से 6%, सल्फरयुक्त अमीनो एसिड 2% से 3%, और ट्रिप्टोफैन 0.6% से 0.8% होता है। मछली के वसा में अत्यधिक असंतृप्त वसा अम्लों का बड़ा हिस्सा होता है और इसकी पचनीयता अच्छी होती है।.
मछली का आटा कैल्शियम, आयोडीन, सेलेनियम और अन्य खनिजों का भी एक अच्छा स्रोत है। फॉस्फोरस कैल्शियम फॉस्फेट के रूप में मौजूद होता है, जिसकी उपयोग दर उच्च होती है।.
इसके अतिरिक्त, मछली के आटे में बी विटामिन की उच्च मात्रा होती है, विशेष रूप से विटामिन बी2 और विटामिन बी12। मछली का आटा न केवल उच्च गुणवत्ता वाला प्रोटीन स्रोत है, बल्कि यह एक पशु प्रोटीन युक्त चारा भी है जिसे अन्य प्रोटीन युक्त चारे से आसानी से प्रतिस्थापित नहीं किया जा सकता।.
मछली का आटा प्रजनकों के लिए प्रोटीन और आवश्यक अमीनो एसिड का उच्च-गुणवत्ता वाला स्रोत है, जो चारे के उपयोग में सुधार कर सकता है और प्रजनकों की प्रजनन क्षमता बढ़ा सकता है।.
हालाँकि, मछली आटे की मात्रा को ठीक से नियंत्रित किया जाना चाहिए। मछली आटे की अत्यधिक मात्रा चारे में मछली जैसी गंध पैदा कर देगी और चारा ग्रहण को प्रभावित करेगी। मछली आटे की अनुशंसित अतिरिक्त मात्रा में मुर्गी का चारा 3% से 4% है।.